Il 19 maggio 2021, la variante Delta ( Delta Variant of Concern, VOC ), precedentemente nota come VOC indiana o B 1.617.2, è diventata il ceppo dominante di SARS-CoV-2 in Scozia.
La variante Alfa VOC ( precedentemente nota come Kent VOC, B.1.1.7, o gene S negativo ) era stata il ceppo dominante in precedenza, ma è stata rapidamente sostituita.
I campioni sono stati analizzati utilizzando TaqPath RT-PCR di ThermoFisher, che verifica la presenza di tre geni bersaglio di SARS-CoV-2.
I campioni negativi al gene S avevano una delezione nel gene S di B.1.1.7 ( Alfa VOC ) in posizione 69-70, con valori di soglia del ciclo ( Ct ) inferiori a 30 per almeno uno dei geni OR e N.
I campioni positivi al gene S avevano valori Ct inferiori a 30 per il gene S e valori Ct validi per gli altri due geni.
Per contro, un campione debolmente positivo al gene S aveva una Ct di 30 o meno per S.
I dati di sequenziamento dalla Scozia hanno rilevato che dal 1 aprile al 28 maggio 2021, l'ultima data fino alla quale i dati erano disponibili, il 97% di casi positivi al gene S sequenziati in Scozia erano la variante Delta e il 99% delle varianti Delta era positivo al gene S.
EAVE II è una piattaforma di sorveglianza COVID-19 in tutta la Scozia che è stata utilizzata per monitorare e prevedere l'epidemiologia di COVID-19, informare la stratificazione del rischio e studiare l'efficacia e la sicurezza dei vaccini. Comprende set di dati sanitari nazionali su 5.4 milioni di persone, circa il 99% della popolazione scozzese.
È stata utilizzata la piattaforma EAVE II per intraprendere un'analisi di coorte per descrivere il profilo demografico dei pazienti COVID-19, studiare il rischio di ricovero ospedaliero per COVID-19 e stimare l'efficacia del vaccino nella prevenzione dei ricoveri ospedalieri COVID-19 nei casi positivi al gene S.
È stato anche impiegato un disegno negativo al test per stimare l'efficacia del vaccino contro il rischio di infezione da SARS-CoV-2.
Questa analisi si è basata su tutti gli individui che avevano un test PCR per SARS-CoV-2 nel periodo di studio e ha confrontato le proporzioni positive tra gli individui vaccinati al momento del test del tampone con quelli non-vaccinati al momento del test, aggiustando per demografia e covariate temporali.
Basandoci su metodi precedentemente descritti in dettaglio, è stato definito un ricovero ospedaliero COVID-19 entro 14 giorni dal test positivo per SARS-CoV-2.
Sono stati inclusi anche gli individui che sono risultati positivi entro 2 giorni dopo un ricovero ospedaliero.
Sono stati esclusi gli individui testati durante una degenza ospedaliera dal giorno 3 in poi. Sono state escluse le infezioni da COVID-19 acquisite in ospedale.
L’analisi ha coperto il periodo dal 1 aprile al 6 giugno 2021, per la distribuzione demografica dei casi.
Entro il 1 aprile 2021, il 44.7% della popolazione in Scozia aveva ricevuto una dose del vaccino COVID-19 e il 7.6% aveva ricevuto due dosi.
Tra le persone di età pari o superiore a 65 anni, le percentuali erano rispettivamente del 91.2% e del 15%.
Alla fine del periodo di studio, 6 giugno 2021, il 59.4% aveva ricevuto una dose e il 39.4% due dosi; le proporzioni corrispondenti erano rispettivamente del 91.7% e dell'88.8% per le persone di età pari o superiore a 65 anni.
Ci sono state 19.543 infezioni da SARS-CoV-2 confermate nel periodo di interesse, di cui 377 sono state ricoverate in ospedale per COVID-19; 7.723 ( 39.5% ) di questi casi e 134 ( 35.5% ) ricoveri ospedalieri sono stati tra coloro che erano positivi al gene S.
Casi positivi al gene S si sono verificati in tutte le età, con una proporzione maggiore di soggetti positivi al gene S di età compresa tra 5 e 9 anni rispetto ai casi negativi al gene S.
C'è stato un leggero gradiente di deprivazione inverso con casi positivi al gene S osservati in modo sproporzionato nel quintile più ricco dal punto di vista socioeconomico.
La maggior parte dei casi ( 70% ) non presentava comorbilità rilevanti alla base.
Il 70% dei casi positivi al gene S non aveva ricevuto alcuna dose di vaccinazione COVID-19, rispetto al 75% dei casi negativi al gene S.
L'analisi di regressione di Cox per il tempo al ricovero ospedaliero ha rilevato che i casi positivi al gene S erano associati a un aumentato rischio di ricovero ospedaliero per COVID-19: hazard ratio ( HR ) 1.85 rispetto ai casi negativi al gene S, dopo aggiustamento per età, sesso, deprivazione, trend temporale e comorbilità.
Un numero maggiore di comorbilità rilevanti per il COVID-19 ha aumentato il rischio di ricovero ospedaliero per COVID-19.
Nel complesso, un forte effetto del vaccino non si è manifestato chiaramente fino ad almeno 28 giorni dopo la prima vaccinazione ( HR 0.32 ).
Tra i casi negativi al gene S, l'effetto della vaccinazione, almeno 28 giorni dopo la prima o la seconda dose, è stato quello di ridurre il rischio di ricovero ospedaliero ( HR 0.28 ) rispetto ai non-vaccinati.
Il corrispondente hazard ratio per il rischio di ricovero ospedaliero per i casi positivi al gene S è stato 0.38, con un valore P del test di interazione di 0.19, suggerendo che non vi fosse evidenza di un effetto differenziale del vaccino sui ricoveri ospedalieri tra i primi risultati positivi.
Considerando l'intera coorte di popolazione invece dei soli casi ospedalieri, l'analisi negativa al test per stimare l'efficacia del vaccino nella prevenzione dell'infezione da SARS-CoV-2 confermata dalla RT-PCR ha mostrato che, rispetto alle persone non-vaccinate, almeno 14 giorni dopo la seconda dose, Comirnaty ( BNT162b2; vaccino Pfizer-BioNTech ) offriva un'ottima protezione: 92% per casi gene S negativi, 79% gene S positivi.
La protezione associata a Vaxzevria ( ChAdOx1 nCoV-19; vaccino Oxford-AstraZeneca ) è stata sostanziale, ma ridotta: 73% per casi gene S negativi rispetto al 60% per casi gene S positivi.
Poiché c'è stata una tendenza nella captazione del vaccino e una tendenza all'aumento della variante Delta, l'adeguamento temporale con una tendenza generale potrebbe non tenere pienamente conto di questi cambiamenti. Inoltre, non è stato effettuato alcun test di significatività formale per confrontare i vaccini.
Cambiamenti simili negli effetti del vaccino almeno 14 giorni dopo la seconda dose sono stati osservati per il vaccino Comirnaty quando è stata limitata l'analisi a coloro che riportavano sintomi al momento del test, ma con intervalli di confidenza più ampi associati alla ridotta dimensione del campione.
Per il vaccino Vaxzevria, il cambiamento è stato maggiore in quanto l'effetto del vaccino gene S negativo è stato maggiore.
Questi risultati sono coerenti con gli effetti del vaccino Delta VOC pubblicati da Public Health England.
In sintesi, è stato dimostrato che la variante Delta VOC in Scozia è stata trovata principalmente nei gruppi più giovani e benestanti.
Il rischio di ricovero ospedaliero per COVID-19 è approssimativamente raddoppiato nei soggetti con Delta VOC rispetto all'Alfa VOC, con un rischio di ricovero particolarmente aumentato in quelli con 5 o più comorbilità rilevanti.
Sia i vaccini Vaxzevria che Comirnaty sono risultati efficaci nel ridurre il rischio di infezione da SARS-CoV-2 e il ricovero in ospedale per COVID-19 nelle persone con variante Delta VOC, ma questi effetti sull'infezione sono sembrati ridotti rispetto a quelli con la variante Alfa VOC.
C’è stato un numero insufficiente di ricoveri ospedalieri per confrontare i vaccini in questo ambito. Il vaccino Vaxzevria è apparso meno efficace del vaccino Comirnaty nel prevenire l'infezione da SARS-CoV-2 nei pazienti con variante Delta VOC. ( Xagena2021 )
Sheikh A et al, Lancet 2021
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